Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRCPO75575 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRCPO75575 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRCPO75575 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRCPO75575 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRCPO75575 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRCPO75575 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRCPO75575 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRCPO75575 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRCPO75575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRCPO75575 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRCPO75575 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRCPO75575 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRCPO75575 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRCPO75575 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRCPO75575 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRCPO75575 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRCPO75575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRCPO75575 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRCPO75575 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRCPO75575 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRCPO75575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRCPO75575 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRCPO75575 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRCPO75575 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRCPO75575 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRCPO75575 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRCPO75575 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRCPO75575 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRCPO75575 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRCPO75575 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRCPO75575 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRCPO75575 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRCPO75575 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRCPO75575 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRCPO75575 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRCPO75575 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRCPO75575 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRCPO75575 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRCPO75575 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRCPO75575 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRCPO75575 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRCPO75575 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRCPO75575 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRCPO75575 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRCPO75575 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms