Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM9SF1O15321 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM9SF1O15321 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF1O15321 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms