Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BHLHE40O14503 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHE40O14503 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms