Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC1O00299 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC1O00299 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIC1O00299 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms