Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD9O00233 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD9O00233 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD9O00233 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD9O00233 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD9O00233 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD9O00233 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD9O00233 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD9O00233 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD9O00233 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD9O00233 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD9O00233 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD9O00233 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms