Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REXO2Q9Y3B8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms