Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM2AQ9Y2K7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM2AQ9Y2K7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms