Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms