Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT172Q9UG01 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms