Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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