Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPG2Q9UBF2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms