Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL9Q9P2J3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms