Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms