Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGR6Q9HBX8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGR6Q9HBX8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms