Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR3CQ9BUI4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms