Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP8Q99708 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms