Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM47Q96LD4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms