Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms