Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms