Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF4Q8WXU2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAAF4Q8WXU2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms