Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms