Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms