Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms