Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD53Q8N9V6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms