Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMC1Q7Z7K0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms