Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC36A4Q6YBV0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms