Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC174Q6PII3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC174Q6PII3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms