Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms