Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms