Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C10orf55Q5SWW7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C10orf55Q5SWW7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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