Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms