Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYTL3Q4VX76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms