Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP28Q4G0W2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms