Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms