Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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COL24A1Q17RW2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL24A1Q17RW2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL24A1Q17RW2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL24A1Q17RW2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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COL24A1Q17RW2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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