Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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ECM1Q16610 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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ECM1Q16610 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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ECM1Q16610 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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