Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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