Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RYR3Q15413 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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