Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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MKRN4PQ13434 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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