Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLN3Q13286 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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