Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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