Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOS1Q07889 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms