Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms