Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms