Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms