Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms