Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms