Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
THOP1P52888 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
THOP1P52888 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
THOP1P52888 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms