Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3AP49840 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3AP49840 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3AP49840 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms