Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPHP49418 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPHP49418 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPHP49418 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMPHP49418 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms